DNA模板有RNA污染,做实时PCR有影响么?基因组DNA纯度1.2.0,是RNA污染么?这样的模板做实时PCR有影响么?该怎样解决?

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/28 17:50:29
DNA模板有RNA污染,做实时PCR有影响么?基因组DNA纯度1.2.0,是RNA污染么?这样的模板做实时PCR有影响么?该怎样解决?

DNA模板有RNA污染,做实时PCR有影响么?基因组DNA纯度1.2.0,是RNA污染么?这样的模板做实时PCR有影响么?该怎样解决?
DNA模板有RNA污染,做实时PCR有影响么?
基因组DNA纯度1.2.0,是RNA污染么?这样的模板做实时PCR有影响么?该怎样解决?

DNA模板有RNA污染,做实时PCR有影响么?基因组DNA纯度1.2.0,是RNA污染么?这样的模板做实时PCR有影响么?该怎样解决?
你这个纯度指的是260nm/280nm吗?这个不能区分DNA和RNA的
你是怎么纯化的的DNA,有些方法得到的260/280会在2左右
还有就是你做的PCR是什么PCR?你的引物cover的范围在什么地方?如果不在exton或者有进入intron和non coding seq的地方就无所谓了
而且还要看你的RNA来自何处,如果是同一批细胞或者组织的RNA,有也无所谓啊(我想不出做PCR有什么是必须只能amplify DNA而不能从RNA来的),如果是外源的才会有问题.
一般我们不担心RNA污染DNA的问题,因为RNA更加脆弱,RNase又几乎无所不在
如果你非常担心这个问题的话,以后纯化DNA的时候用DNase free RNase处理一下就不会有问题了

首先确认下,你是用基因组做模板上Q-PCR做表达的吗??? 是做探针的还是荧光染料SYBR Green Ⅰ?

没事。难道你要用DNA做表达么?
如果有内含子的话,长的是DNA片段,没有内含子的话,那就没所谓了

是做拷贝数检测吗?
DNA纯度1.9~2.0,实际还算正常咯,建议你跑个电泳 看一下 有没有降解及大坨的RNA.如果没有降解的话,做模版应该没问题;如果确实有很多RNA(我估计不太可能),也没关系,RNA很易降解的,你将样品在四度放几天说不定RNA就没了,实在不行的话,你加点DNase- free RNase 37度处理30min,酚/氯仿抽提,然后无水酒精沉淀,ok...

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是做拷贝数检测吗?
DNA纯度1.9~2.0,实际还算正常咯,建议你跑个电泳 看一下 有没有降解及大坨的RNA.如果没有降解的话,做模版应该没问题;如果确实有很多RNA(我估计不太可能),也没关系,RNA很易降解的,你将样品在四度放几天说不定RNA就没了,实在不行的话,你加点DNase- free RNase 37度处理30min,酚/氯仿抽提,然后无水酒精沉淀,ok

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一般的PCR没事的,直接做就好了!

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