什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗?
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/15 10:19:27
什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗?
什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗?
什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗?
“普通的基因测序”应该是指“常规DNA测序”吧,是用Sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长.
高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的.
不过到2005年以后,高通量测序就改指第二代测序(Next generation sequencing),454、Solexa(后改为Illumina)和SOLiD等第二代测序,比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序.
NGS的特点主要有:
1、通量高,一个RUN能产生500Mb-600Gb的数据量
2、读长相对较短,454(约400-500bp),Illumina(100-250bp),SOLiD(75-100)
3、单位数据的成本非常低,现在很多项目测序的费用,已经非常低,生物信息分析成本变得更为重要了.
普通的基因测序即常规测序,高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些...
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普通的基因测序即常规测序,高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deepsequencing)。
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高通量测序深度更深,覆盖率更高。
奥拓基因是使用美国Otogenetics Corporation的技术。公司产品重点是为科研和临床检验提供新一代高通量测序产品和服务。本技术得到了美国国立卫生院创新技术基金的支持,以及Roche NimbleGen和Agilent的正式认可。目前完全符合GLP。奥拓已经处理了大量外显子组样本大规模的疾病和代谢基因组的高通量测序样本,以及RNA测序(RNA-...
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高通量测序深度更深,覆盖率更高。
奥拓基因是使用美国Otogenetics Corporation的技术。公司产品重点是为科研和临床检验提供新一代高通量测序产品和服务。本技术得到了美国国立卫生院创新技术基金的支持,以及Roche NimbleGen和Agilent的正式认可。目前完全符合GLP。奥拓已经处理了大量外显子组样本大规模的疾病和代谢基因组的高通量测序样本,以及RNA测序(RNA-Seq)样本。通过为我们的服务或产品提供书面保证,对每个项目和客户提供保证,我们已经建立了一个毋庸置疑的高质量的声誉。
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